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Nature 教你如何选择电子实验记录系统
来源:研发创新平台
以前,我和团队成员并不认为我们会需要电子实验记录本,我们更习惯于在便签纸上记下实验进展;但仅经过短短三个星期的电子实验记录本使用后,我们更情愿只通过简单的点击就完成相关操作,节约更多的休闲时间。」
——柏林健康研究所的实验神经学家 Ulrich Dirnagl
Nature Toolbook 06 AUGUST 2018

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Nature 作为全球顶级的自然科学期刊竟然为实验类管理工具的推行摇旗呐喊?


8 月 6 日全球顶级的自然科学期刊 Nature 撰文:《如何选择电子实验记录本产品》(How to pick an electronic laboratory notebook)。在化学和生物界实验室引起了很多的议论。事实上,从上世纪 90 年代开始,就有人预言电子实验记录系统必将在科研界得到广泛的应用,但如今我们可以看到事情的进展并非如预期所顺利。本次 Nature 的撰文,似乎可以为我们解答一二。

在文章的开始,作者表示:从二十世纪 90 年代开始,已经有技术专题预测电子实验记录本将会得到广泛的应用。然而直到现在,这种情况还是没有发生。一个非常大的障碍就是产品的普适性。目前科研领域的多样性导致对电子实验记录系统的需求也是多种多样,这导致市场上出现了非常多的电子实验记录系统产品,而过多的产品让研究人员很难选择。

然而,伴随着数字化技术成长的新一代研究者们,则更倾向于使用和拥抱电子化的解决方案。当科学家需要处理大幅增长的数据时,采用纸质记录本上的数据变的非常过时。对可再现性的关注,以及监管机构对数据管理的更严格要求,推动了实验室文档管理的进步。电子实验记录本(ELN)市场上也出现了更加强大的产品,例如基于云计算的产品——这让 ELN 无需 IT 部门的支持和安装即可直接使用

很多亲历者都感觉到了这种转变正在悄悄到来,例如剑桥大学 Gurdon 研究所的 IT 负责人 Alastair Downie 就深有同感「我确实感受到我们正在接近转折点」。

是什么原因带来这这种转变呢?文章给出了支持者的理由。

ELN 与纸质记录相比存在许多优势


• 它们易于检索、复制和归档。
• 通过创建模板,科学家不必浪费时间在重复编写实验方案上。
• 研究人员可以把实验与特定的样本或文件联系起来,也可以很容易地与其他实验室成员和协作者共享信息,从而促进可再现性。
• 监督员可以远程监控他们团队的活动。
    

当然文章也给出了 ELN 存在的不足:


• 虽然许多公司都提供免费版本的 ELN 软件,但这些软件通常对用户数量、数据存储或文件大小都有限制(随着研发数据量的激增,上述限制可能不得不通过合理收费的产品来解决)。
• 很多产品只有 PDF 输出数据,非可编辑模式阻碍了数据在系统间互联互通(应该选择可输出多种格式,并支持标准的文件格式的产品;同时,支持多系统互联的产品可能会更便捷)。

• 网络中断可能暂时限制对数据的访问(这可能是选择本地部署软件产品最头疼的问题之一,选择有保证云端产品可有效避免上述风险)。


尽管存在这些缺点,越来越多的研究人员正在走向数字化。对于如何选择更合适的电子实验记录产品,Nature 给出了以下几点建议:


  • 学习:在线资源可以给潜在用户提供全面了解 ELN 市场的机会。在国外的网站上有专门评价 ELN 产品的网站,但在国内还没有专业的网站来做这方面的工作,因此建议国内用户最好能通过试用或者用户口碑来了解需要选择的电子实验记录系统。

  • 计算费用:在国外学术界,使用的大多数 ELN 服务的付费账号每月花费 10 到 20 美元(云端账号),而免费版则对存储以及工具都有限制。(国内据了解现在云端产品一般的费用为每月每账号人民币 100 元左右,和国内的收入水平来看,处于一个比较合理的水平。)

  • 合规问题:如研发数据必须作为监管过程的一部分提交给美国食品和药物管理局(FDA),那么选择能够锁定和电子签名完整页面的 ELN 软件可能是至关重要的。

    在我国,监管机构对研发数据的可重现性也越来越重视,2018 国务院出台了《科学数据管理办法》提到加强科学数据的管理,把数据安全和共享放在首位。

  • 评估稳定性:研究人员需要评估 ELN 公司的生存机会。

    盐湖城犹他大学的研发数据管理员 Daureen Nesdill 建议:选择一家成立至少 5 年、资金稳定、服务条款规定的公司,如果公司倒闭或被出售,用户将能够访问他们的数据。

  • 移动应用:有些实验室喜欢能在移动设备上运行的 ELNs。

    和传统的电子记录系统相比,研究人员不愿意放弃纸质记录的一个重要原因就是纸质记录的便捷性,使用者可以随时记录实验过程中的数据,而不需要一台安装有 ELN 客户端的电脑。通过在移动设备上允许的 ELN 产品,方便使用移动设备的麦克风通过语音录入文字,使用相机拍摄仪器和结果的照片,并用触笔注释图像。

  • 软件集成:ELN 和最喜欢的软件进行集成可能会给一些科学家带来好处。

    例如化学家希望 ELN 产品能兼容 Chemdraw,使得结构能够添加到 ELN 中。

  • 进行试用:Jones 建议试用一下 ELN 产品的免费版本。

    通过试用,看看使用是否方便,界面是否友好,能否满足自己领域的特性。例如生物测试实验室的研究者喜欢产品提供的丰富的生物测试模板,这样可以免除自己整理实验记录模板的烦恼;而合成化学家希望 ELN 提供化学反应的支持,最好能生成合成路线图;而分析测试实验室则更希望 ELN 能提供协作的工具,以便更准确的把需要的数据传递给请求者。

  • 接受改变:以开放的心态迎接改变,而不是浅尝辄止。

    信息化已经深入到我们生活的各个角落,我们每天用社交软件在获取信息,用手机支付进行购物并乘坐公共交通,信息化会让我们的生活更加方便。同样在实验室里,我们也应该以开放的心态去迎接信息化的到来,来享受信息化大潮给我们带来的便捷,并最终推动研发创新模式的变革。

    现在您知道如何选择一款适合您使用的 ELN 产品了吗?

    没错,记录这几个关键词价格,合规问题,供应商生存时间,移动应用,试用,并接受改变

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