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讲座直播 | 3月生命科学专题:BIOVIA Discovery Studio 2021版本新功能介绍
来源:计算机模拟平台

讲座主题BIOVIA Discovery Studio 2021版本新功能介绍

讲座时间2021年3月5日(周五),14:00

直播地址点击此处立即报名 ,或扫描下方二维码


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(打开后记得收藏哦,进入直播间不迷路)

讲座内容

本次讲座主要针对向大家解读与展示BIOVIA Discovery Studio 2021版本新功能简介。


分子动力学模拟

•  新增MSLD Bias Optimization and Production:简化了用于计算组合库分子相对结合自由能工作流程,更好地进行先导化合物的筛选优化;模拟竞争性结合,经过验证,计算效率是传统FEP的20倍。


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1:通过MSLD方法计算组合库中分子的相对结合自由能


•  新增支持GPU(Linux)的基于CHARMm-DOMDEC的自由能微扰方法程序CHARMm Relative FEP Calculations计算相对结合自由能。


•  对一些程序增加了支持GPU计算的功能,提高了计算速度和效率,如:

Dock Proteins (ZDOCK):比CPU快十几倍。

Dynamics (NAMD) 和 Solvate with Explicit Membrane:比8 CPUs快7倍。


抗体理性设计

•  改善了计算抗体黏度、聚集等计算结果呈现方式,增加电荷表面和聚集打分表面的显示;


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2:增加电荷表面和聚集打分表面图


•  优化Predict Humanizing Mutations protocol(抗体人源化计算)参数,使得导入germline文件更加容易。


药效团

• 改善了药效团数据库和基于配体的药效团方法,加入了基于非键相互作用的药效特征。


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3:基于非间相互作用药效特征


第三方程序的更新

•  CHARMm版本更新至c44b2

•  MODELER版本更新至v9.24

•  Dmol3版本更新至v2021

•  抗体模板库更新至2020年7月


 与最新发布的BIOVIA Pipeline Pilot 2021相兼容


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注: 本次网络培训属于2021年生命科学模拟技术系列讲座,我们会陆续推出后续的讲座,最新讲座安排请关注我们的网站或联系我们索取相关资料。