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2020年3月 | DS2020版本新功能介绍在线讲座
来源:计算模拟平台

讲座主题Discovery Studio 2020版本新功能介绍

讲座时间:2020年3月6日(周五),下午14:00

主讲人:罗芳(产品技术支持,生命科学部门)

注册地址:点击此处立即报名 

(注册后,您将收到一封登录地址链接的邮件,按照屏幕上显示的说明进行操作。)

讲座内容

分子动力学模拟

  • 新增Multi-Site Lambda Dynamics method(MSLD):用于计算大型类属库分子的相对结合自由能,更好地进行先导化合物的筛选优化;且可以用GPU计算;


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图1:通过MSLD方法计算组合库中分子的相对结合自由能


  • 新增显式膜结构的跨膜蛋白的分子动力学计算。提供多种类型的磷脂膜结构,同时支持自定义膜类型。

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图2:在POPC显式膜内溶剂化的hERG离子通道


抗体理性设计

  • 新增计算抗体黏度,蛋白溶解度;

  • 优化Predict Humanizing Mutations protocol(抗体人源化计算)参数,可以同时自定义重链(H)和轻链(L)的V基因和J基因。


药效团

  • 新增Ensemble Pharmacophore Generation:从一组活性配体生成一组共同特征的药效团。活性配体使用2D指纹进行聚类。对于每个聚类,从聚类中心选择5个配体,然后使用共同特征药效团算法创建药效团;

  • 新增Interaction Pharmacophore Generationprotocol:从受体-配体复合物的非键相互作用出发产生药效团模型。


第三方程序的更新

  • CHARMm版本更新至c43b2

  • MODELER版本更新至v9.22

  • DMOL3版本更新至v2020

  • 抗体模板库更新至2019年7月


与最新发布的BIOVIA Pipeline Pilot 2020相兼容

若您想对以上新功能做进一步了解和获取更多Discovery Studio 2020新功能信息,点击下方按钮报名参加Discovery Studio 2020在线发布会!  


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