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产品名称(英文):Neosuite MNPD

产品名称(中文):微生物天然产物数据库

软件厂家:NeoTrident

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产品简介:

(NeoSuite Microbial Natural Products Database, NeoSuite ) 创腾科技有限公司和中国医学科学院生物技术研究所联合开发的综合性天然产物数据库。

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 (NeoSuite Microbial Natural Products Database, NeoSuite )
      创腾科技有限公司和中国医学科学院生物技术研究所联合开发的综合性天然产物数据库。MNPD是基于Symyx 公司的ISIS Base化学信息管理系统构建的,在数据库设计和数据采集上借鉴了多个已发布的天然产物数据库的经验,数据内容涵盖了近几十年来主要相关文献,专利及专著中的微生物代谢物共15000多个,其中有确切化学结构式的共10000多个。化合物的相关信息包括来源,制备,理化性质,化学结构,生物活性以及原始文献等数据。MNPD可以为从事药物化学,微生物学,生物化学,药理学,新药筛选,天然产物研发,组合化学,化学信息学等领域的科研人员提供极大的帮助,如天然产物的结构检索,虚拟药物筛选,构效关系研究,作为组合化学的初始结构等。


1、简介
     微生物天然产物数据库(Microbial Natural Products Database,MNPD)是创腾科技有限公司和中国医学科学院医药生物技术研究所联合开发的综合性天然产物数据库。MNPD是基于MDL公司的ISIS Base化学信息管理系统构建的,在数据库设计和数据采集上借鉴了多个已发布的天然产物数据库的经验,数据内容涵盖了微生物天然产物的来源、制备、理化性质、化学结构、生物活性以及原始文献等各方面信息,形成了数据全面、可满足多种功能需求的综合性的化学信息数据库。

2、数据库特性
     首先,占全球80%市场份额的MDL ISIS化学信息管理系统拥有其独特的优势,能够方便的建立、管理和检索化学信息数据库,并且可以利用通用接口十分方便的与其他系统如Accelrys和Tripos公司提供的分子模拟及分子设计软件配合使用。使用者无需计算机专业知识,只需进行简单培训即可对数据库进行检索、浏览和维护。另外,据不完全统计,迄今已从各种微生物发酵产物中分离得到20000多种代谢产物纯品,其中具有生物活性的代谢产物达16000多种。而MNPD收集了近几十年来主要相关专业文献、专利及专著中的微生物代谢产物共15000多个,其中有确切化学结构式的共10000多个。这些多样性的结构完全覆盖了附表中所列出的所有微生物次级代谢产物的类别。

3、数据库内容
MNPD收集的信息包括以下各个方面的内容:
• 基本信息:微生物天然产物的俗名、别名、IUPAC命名、分子式、分子量、化合类型、CAS登记号等
• 物化性质和谱图信息:微生物天然产物的颜色、晶型、熔点、旋光度、溶解性、紫外和红外特征吸收峰等
• 结构信息:已确定的微生物天然产物的二维分子结构式及利用分子力学方法优化得到的三维分子结构
• 来源和生物活性:微生物产物的产生菌、制备方法及生物活性测试结果
• 原始参考文献及专利信息

► 问:Neosuite MNPD数据库收录了那些类型的化合物? 这些化合物有什么特点?

     答:收录了自20世纪80年代起文献研究报道的微生物来源抗生素及其他次级代谢产物。微生物的次级代谢产物的结构具有“类药性”,是新型药物来源的主要天然资源化合物库。

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