计算生物学-阻燃剂对生态环境慢性毒性效应的评测

时间:2015-04-27

分子对接(molecular docking):基于结构的药物设计技术在药物研发中起着非常重要的作用。基于结构的药物设计主要采用的是分子对接技术。分子对接就是把配体分子放在受体活性位点的位置,然后按照几何互补、能量互补以及化学环境互补的原则来实时评价配体与受体相互作用的好坏,并找到两个分子之间最佳的结合模式。分子对接是从整体上考虑配体与受体结合的效果,能够较好避免其他方法中容易出现的局部作用较好而整体结合欠佳的情况。
 

Ref:Environ. Sci. Technol. 2014, 48, 6995−7001 IF=5.481

链接:dx.doi.org/10.1021/es5007862
 

      阻燃剂(FRs)可以对环境和生态产生慢性毒性影响,本文研究9种常见的含磷阻燃剂对人的内分泌系统的影响。首先通过分子对接的方法,采用LigandFit模块,将9种FRs对接到hERa受体中,采用多种打分函数对结合模式进行打分,最后采用一致性打分的方式,选择最优的结合模式。结果表明,TPP与hERa的结合是最强的,并且和hERa的3个疏水的口袋都有疏水的相互作用。之后通过DS CHARmm优化TPP与hERa的结合,通过RMSD和能量的分析,证明TPP和hERa的结合的稳定性。

 

 

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