药物设计-灵芝菌属各有效组分的靶标的搜寻

时间:2015-02-13

Ref:Phytochemistry xxx (2014) xxx–xxx IF=3.35

DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.phytochem.2014.10.010
 

       灵芝作为一种传统的中草药在亚洲地区广泛的应用,灵芝含有多种有用的药用成分,具有抗肿瘤、抗菌、增强免疫、抗高血压、降血脂等功能。现确定的灵芝有效成分包括羊毛烷、三萜类等多种化合物,由于灵芝有效成分复杂,所以目前还不能通过层析分离技术对其成分进行提取。本文通过计算模拟的方法,采用多种模拟技术,确定了灵芝个有效成分所对应的靶标蛋白,解决了各个有效成分对应着相应的生物活性的问题,并且最后体外实验验证了模拟实验的结果。首先,作者确定了灵芝279个有效的组分,之后作者采用基于结构和基于受体两种方法确定了529个药效团模型,其中基于受体的药效团模型从PharmDB数据库中进行选择。529个药效团模型包括灵芝的两大类靶标--抗病毒感染(320)和代谢综合征(209)。之后在作者采用DS Ligand Profiler进行反向找靶的工作,最后作者确定了个有效成分可能的靶标,并结合已有的靶标信息对可能的作用机制进行了分子水平上的分析。

 

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