蛋白设计-非糖基化的谷胱甘肽催化机制的研究

时间:2014-12-08

蛋白表面静电势(Electrostatic Potential)计算方法可以分析蛋白表面静电势,间接分析分子间静电相互作用,或分析突变蛋白的静电势变化情况等。Discovery Studio中的Delphi模块是经典而强大的分子静电分析工具,可以快速计算得到蛋白静电势表面,便于直观分析蛋白表面的电荷分布情况。
 
非糖基化的谷胱甘肽催化机制的研究
ref:Scientific Reports 2014 ,Article number:6698 IF=5.079
链接:http://www.nature.com/srep/2014/141021/srep06698/full/srep06698.html
 
      通过实验研究发现,rhGPx3在溶液中是以单体的形式存在,而不是像GPx3是以四聚体为单位发挥催化活性。rhGPx3的活性比较低是由于rhGPx3缺乏糖基化修饰和没有形成四聚体造成的。通过计算模拟的方法,作者对rhGPx3和GPx4进行了结构的比对,发现除了寡聚环之外,其它的结构非常相似。之后作者又通过Delphi进行表面电荷的分析,GPx4寡聚环区域表现为正电性,在活性口袋位点可以有效的结合磷脂分子并形成四聚体。而rhGPx3的寡聚化区域是亲水环境并且带有负电荷,限制了活性位点结合磷脂分子,从而以单聚体的形式存在。
 
 
为什么选择Discovery Studio?
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