药物设计-抗癌药物HMJ38双靶标抑制剂的设计

时间:2014-10-22

分子对接:是基于结构药物设计的核心模拟手段,依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程,模拟受体-配体相互作用,预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术,科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选,药物分子的结构改造,药靶相互作用的机理研究等工作,从而大大提高实验效率。在Discovery Studio这一分子模拟的综合平台中,共有四种对接程序,包含Libdock、LigandFit、CDOCKER、FlexibleDocking,这四种对接算法各有优势,能够满足广大科研工作者的多种应用需求,为其提供配体受体间相互识别的“利器”。
 

抗癌药物HMJ38双靶标抑制剂的设计

refBritish Journal of Pharmacology (2013) 169 1574–1586IF=4.99

链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3724113/
 

      在分子对接试验中,我们发现将HMJ38对接到微管蛋白的长春碱结合部位,该位点具有更多的引入取代基的自由空间,并且在活性位点附近有许多的氨基酸残基。这允许引入更大的取代基到HMJ38位置中,通过分子对接研究发现,MJ系列化合物更好的和微管蛋白进行结合。另外,研究发现MJ65-70可以活化JNK2蛋白的表达。通过分子对接研究表明,MJ65-70可以非常好的结合JNK2蛋白,并且对接结果与前期的western blot的实验结果一致。综上,本文通过CADD的方法,发现了一系列新的先导化合物,并且MJ65-70化合物可以同微管蛋白和JNK2蛋白同时进行作用。

                              

 

为什么选择Discovery Studio
1.  Discovery Studio中共有四种对接程序,这四种对接算法各有优势,能够满足广大科研工作者的多种应用需求;
2.  Discovery Studio中有多种对接结果的评价分析手段,包括2D/3D相互作用图分析(可以分析氢键、疏水作用、卤键等多种非键作用类型)、结合口袋表面分析、氢键热图、多种打分函数、结合能的计算等;
3.  Discovery Studio应用广泛,操作简便,图形化界面十分友好,结果易于分析。