药物设计 - HIV蛋白酶抑制剂药效团的并行筛选和活性分析

时间:2014-08-08

 

HIV蛋白酶抑制剂药效团的并行筛选和活性分析

Parallel Screening and Activity Profiling with HIV Protease Inhibitor Pharmacophore Models

参考文献:J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 563-571

文献链接:http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ci600321m

 

图1 Pipeline Pilot开发的网页版的药效团并行筛选图形界面。左侧栏:用户操作界面,选择药效团集合,以及设定要进行筛选的化合物分子文件或者数据库。右侧界面:筛选结果,用热图来表示每个化合物与药效团的匹配好坏,纵轴为分子的名称,横轴为药效团名称,分子与药效团匹配的好坏用颜色来表示,从深红色表示最好,依次递减,浅蓝色表示最差,黑色表示不匹配。右上角:显示化合物与对应药效团匹配图片。

 

 

图2 查看活性分子的具体匹配情况。分子的2D结构(左侧);分子与药效团的匹配结果,3D显示可操作(中间);分子与所有药效团的匹配情况,用柱图显示。

 

图3 筛选结果可以导出为EXCEL格式。