药物设计 - 毒扁豆碱和加兰他敏作用烟酰乙酰胆碱活性位点的研究

时间:2014-06-05

分子对接(molecular docking):基于结构的药物设计技术在药物研发中起着非常重要的作用。基于结构的药物设计主要采用的是分子对接技术。分子对接就是把配体分子放在受体活性位点的位置,然后按照几何互补、能量互补以及化学环境互补的原则来实时评价配体与受体相互作用的好坏,并找到两个分子之间最佳的结合模式。分子对接是从整体上考虑配体与受体结合的效果,能够较好避免其他方法中容易出现的局部作用较好而整体结合欠佳的情况。

 

毒扁豆碱和加兰他敏作用烟酰乙酰胆碱活性位点的研究

ref:J Neurosci . 2013 January 9 : 33(2): 485-494 IF=6.908

链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3542985/

      作者通过毒扁豆碱和加兰他敏的光反应特性,确定了nAChR中那些氨基酸对于结合位点的结合做出的贡献最大,得到了四个主要的氨基酸残基Tyr-111、Tyr-117、Tyr-212、Tyr-105。之后作者基于Tyr-111、Tyr-105来定义两个活性区域,采用CDOCKER的方法,将毒扁豆碱和加兰他敏对接到nAChR中,以CDOCKER INTERANTION ENERGY为打分函数。最后通过对接分析得到了加兰他敏和毒扁豆碱作用nAChR的三个活性区域。

 

 

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