化学信息学 - 基于Pipeline Pilot定制开发的支持180多种不同光谱格式的reader组件

时间:2014-06-05

基于Pipeline Pilot定制开发的支持180多种不同光谱格式的reader组件
 

      作为一款综合性的科研信息化计算平台,PP本身就拥有功能丰富的Analytical Instrumentationcollection(AIC)模块,用户可以基于已有的AIC功能组件在PP中搭建工作流来处理和分析多种实验室分析仪器产生的数据,并将分析结果进行可视化输出。由于任何软件系统在进行数据分析工作之前,都需要将外部数据源的数据正确的读入系统中,所以不同格式的Reader组件也是PP平台中最常见的一类功能组件之一。PP的AIC模块能够支持读取多种仪器格式的数据,如图1所示。为了进一步提高AIC模块的兼容性,本文将介绍如何通过Pipeline Pilot集成GRAMS软件中的SmartConvert技术,实现支持上百种光谱格式的Reader组件的定制开发。拓展了PP的AIC模块在光谱处理和分析研究领域的应用,从而能够保证使用PP的AIC模块进行光谱分析和建模时能够兼容市面上的绝大多数光谱仪器类型(如Agilent/HP、Beckman、Bio-Rad、Bruker、Gilson、Hitachi、PerkinElmer、Shimadzu、Varian和Waters/Micromass等等),其中图2为我们定制开发的Reader及其使用方法的示意图。

 
图1.Pipeline Pilot中已有的各种仪器数据格式的Reader组件
 
图2.支持多种仪器格式的Reader组件(参数项)及使用示意图